Del 6 al 9 de Mayo, 2024
Curso de ensamblaje y preparación de genomas de referencia para el Earth Biogenome Project
Earth Biogenome Project (EBP) aspira a secuenciar, ensamblar, catalogar y caracterizar el genoma de todas las especies de eucariotas en la Tierra. Esto es posible gracias a avances sustanciales que han tenido lugar en los últimos años, tanto en el campo de las tecnologías de secuenciación como en el de los recursos y herramientas bioinformáticas. Los ensamblajes de genomas generados como parte del EBP deben cumplir ciertos estándares de calidad para asegurar su contigüidad, precisión, que estén enteros y que haya representación cromosómica. En este curso de 4 días nos enfocaremos en cómo obtener ensamblajes de gran calidad a nivel cromosómico, mostrando como producir ensamblaje de genomas con fragmentos largos y datos Hi-C. Cubriremos todos los pasos necesarios para producir y evaluar un ensamblaje de genoma, poniendo especial atención al paso de tratamiento manual.