Autor: centrebaleardebiodiversitat

Earth Biogenome Project (EBP) aspira a secuenciar, ensamblar, catalogar y caracterizar el genoma de todas las especies de eucariotas en la Tierra. Esto es posible gracias a avances sustanciales que han tenido lugar en los últimos años, tanto en el campo de las tecnologías de secuenciación como en el de los recursos y herramientas bioinformáticas. Los ensamblajes de genomas generados como parte del EBP deben cumplir ciertos estándares de calidad para asegurar su contigüidad, precisión, que estén enteros y que haya representación cromosómica. En este curso de 4 días nos enfocaremos en cómo obtener ensamblajes de gran calidad a nivel cromosómico, mostrando como producir ensamblaje de genomas con fragmentos largos y datos Hi-C. Cubriremos todos los pasos necesarios para producir y evaluar un ensamblaje de genoma, poniendo especial atención al paso de tratamiento manual.

Personal docente

Tyler Alioto (CNAG)

Jèssica Gómez-Garrido (CNAG)

Asistencia de Karen Schöninger (CBB-UIB)

Cuando y donde

06/05/2024 al 09/05/2024

10h a 17h

Edifici complex M2 (Carrer Blaise Pascal, 7, Parc Bit)

Inscripciones

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Etiquetas 2024

Cursos

Curso de introducción a la secuenciación con Nanopore: fundamentos y análisis

Autor de la entrada Por centrebaleardebiodiversitat
Fecha de la entrada abril 15, 2024

Del 15 al 17 de Abril, 2024

Curso de introducción a la secuenciación con Nanopore: Fundamentos y análisis

En este curso ofreceremos una visión general de la secuenciación con Nanopore, con énfasis en la aplicación de esta tecnología en el estudio de ensamblaje de genomas, secuenciación de zonas concretas con enriquecimiento en laboratorio e informático, estudios de amplicones y abriendo otras posibilidades como secuenciación directa de ARN o detección de cambios epigenéticos. El curso incluye charlas teóricas, demostraciones de laboratorio de la preparación de librerías y cargado de la flowcell para secuenciación, así como las diferentes herramientas bioinformáticas para la utilización de los datos generados por Nanopore.

Personal docente

Dr. Ramón Gallego Simón (UAM)

Ana Isabel Ramón-Laca (MNCN – CSIC)

Asistencia de Lluís Moragues y Laura Triginer (CBB-UIB)

Cuando y donde

15/04/2024 a 17/04/2024

9:30h a 13:30h

Edifici Antoni Maria Alcover UIB

Inscripciones

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Etiquetas 2024

Cursos

Curso de introducción a la filogenia

Autor de la entrada Por centrebaleardebiodiversitat
Fecha de la entrada abril 8, 2024

Del 8 al 11 de Abril, 2024

Curso de introducción a la filogenia

Este curso introductorio a la filogenia está concebido dotar a los asistentes de una base sólida en los conceptos esenciales de la filogenética, y proporcionarles las herramientas necesarias para analizar de manera autónoma las relaciones evolutivas entre organismos. A lo largo del curso, los participantes conocerán los tipos de datos empleados en estudios filogenéticos, la estructura y el manejo de los distintos formatos de archivo, así como los principales métodos de alineamiento de secuencias. Se explorarán diversos modelos evolutivos que fundamentan los métodos de inferencia de árboles filogenéticos, entre los que se incluyen la Máxima Parsimonia, la Máxima Verosimilitud, y los métodos Bayesianos.

Personal docente

Dr. José Antonio Jurado Rivera (UIB)

Dr. Joan Pons Pons (IMEDEA, CSIC-UIB)

Cuando y donde

08/04/2024 a 11/04/2024

9h a 17h

Edifici Antoni Maria Alcover UIB

Inscripciones

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