Investigación

Herramientas

© Antoni Costa

Biodiversidad

WebDescripción
AlgaeBaseBase de datos global que contiene acceso gratuito y abierto a datos de biodiversidad.
BioatlesMapa de biodiversidad de las Islas Baleares.
BiodibalBases de datos local que contiene registros de especies de las Islas Baleares.
Biodiversity Information Standards (TDWG)Organización sin ánimo de lucro y una comunidad dedicada al desarrollo de estándares de información sobre biodiversidad.
Catalogue of LifeBase de datos global que contiene una lista fiable de especies. Es mantenida por cientos de taxónomos globales.
Encyclopedia of Life (EOL)Acceso global al conocimiento sobre la vida en la Tierra.
Ephemeroptera of the worldBase de datos global que incluye nombres válidos, sinónimos, datos bibliográficos, datos de especímenes, imágenes, sonidos y distribución de efemerópteros de todo el mundo.
Euro+Med PlantBaseBase de datos europea que cubre todas las plantas vasculares nativas e introducidas de Europa, el Mediterráneo y el Cáucaso.
Fauna EuropeaBase de datos europea fiable que contiene nombres científicos y distribuciones de todas las especies animales terrestres y de agua dulce multicelulares conocidas actualmente en Europa. 
FishbaseBase de datos global de peces que proporciona información taxonómica, nomenclatural y de distribución.
freshwaterecology.infoBase de datos europea que contiene características autecológicas, preferencias ecológicas y rasgos biológicos, así como patrones de distribución de más de 20,000 organismos de agua dulce europeos pertenecientes a peces, macroinvertebrados, macrófitas, fitobentos y fitoplancton.
Global Biodiversity Information Facility (GBIF)Base de datos global que contiene acceso gratuito y abierto a datos de biodiversidad.
Integrated Taxonomic Information System (ITIS)Base de datos global que contiene información taxonómica fiable sobre plantas, animales, hongos y microbios.
Ocean Biodiversity Information System (OBIS)Base de datos global que contiene datos de acceso abierto e información sobre biodiversidad marina.
Ortoptera of the worldBase de datos global que incluye nombres válidos, sinónimos, datos bibliográficos, datos de especímenes, imágenes, sonidos y distribución de ortópteros del mundo.
Plecoptera of the worldBase de datos global que incluye nombres válidos, sinónimos, datos bibliográficos, datos de especímenes, imágenes, sonidos y distribución de plecópteros de todo el mundo.
Species 2000Base de datos global que contiene información taxonómica que involucra a taxónomos de todo el mundo.
Taxo&MapHerramienta de visualización que poporciona acceso a datos taxonómicos y de distribución geográfica de diferentes especies y grupos taxonómicos. Permite explorar y analizar información sobre la diversidad biológica, la distribución de especies y otros datos relacionados.
World Odonata listListado global de los Odonata del mundo.
World Register of Marine Species (WoRMS)Base de datos global que contiene una clasificación y taxonomía fiable principalmente de especies marinas.

Genética

WebDescripción
Barcode of Life Data System (BOLD)Plataforma que combina herramientas de almacenamiento y análisis de datos desarrolladas para el metabarcoding.
EMBL’s European Bioinformatics InstituteEl Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI) de EMBL mantiene la gama más completa de recursos de datos moleculares disponibles de forma gratuita y actualizada en el mundo.
European Nucleotide Archive (ENA)Base de datos europea que proporciona un registro completo de la información de secuenciación de nucleótidos del mundo, que abarca datos de secuenciación en bruto, información de ensamblaje de secuencias y anotación funcional.
Hight quality ribosomal RNA database (SILVA)Base de datos global que proporciona conjuntos de datos exhaustivos, verificados y actualizados regularmente de secuencias de ARN ribosomal (rRNA) alineadas de subunidades pequeñas (16S/18S, SSU) y grandes (23S/28S, LSU) para los tres dominios de la vida (Bacterias, Arqueas y Eucariotas).
National center for Biothecnology Information(NCBI)Base de datos global que incluye información biomédica y genómica.

Paquete R

WebDescripción
apePaquete para realizar análisis filogenéticos.
BATPaquete que incluye algoritmos para evaluar la diversidad alfa y beta en todas sus dimensiones (taxonómica, filogenética y funcional).
biomod2Paquete que contiene funciones para modelar la distribución de especies, calibración y evaluación, ensamble de modelos, pronóstico de ensamble y visualización.
biomonitoRPaquete para gestionar datos ecológicos y calcular índices de biomonitorización.
dplyrPaquete que proporciona un conjunto de funciones que te ayudan a resolver las manipulaciones de datos más comunes.
enviremPaquete de R para crear variables ambientales útiles para la investigación ecológica.
hypervolumePaquete para estimar la forma y el volumen de conjuntos de datos de alta dimensionalidad. 
rasterPaquete para leer, escribir, manipular, analizar y modelar datos espaciales.
rentrezInterfaz de R para buscar en bases de datos de varios bancos genéticos.
rgbifUna interfaz programática a los métodos de servicios web proporcionados por la Global Biodiversity Information Facility.
rredlistPaquete de R para utilizar las API de la IUCN.
sfPaquete para trabajar con datos espaciales.
terraPaquete para el manejo del análisis de datos espaciales con datos vectoriales (puntos, líneas, polígonos) y datos raster (grilla).
veganPaquete útil para métodos de ordenación, análisis de diversidad y otras funciones para ecólogos.
wdparInterface para aceder al repositorio de las areas protegidas a nivel mundial.

Capas espaciales

WebDescripción
Agencia Estatal de Meteorologia (AEMET)Capas de cartografía AEMET.
Blue HabitatsDatos geomórficos del lecho marino global.
British Oceanographic Data Center (BODC)Datos marinos diversos.
ChelsaDatos climáticos globales de alta resolución.
Copernicus Global Land ServiceTemperatura global de la superficie terrestre.
Copernicus Marine DataDatos marinos diversos (series temporales y datos de teledetección).
CorineCobertura terrestre Corine de Europa.
Eurostat – Geographical information and mapsConjunto de datos de unidades estadísticas que representa la nomenclatura europea de unidades territoriales.
Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO)Datos espaciales diversos.
GADMConjunto de datos global que proporciona mapas y datos espaciales para todos los países y sus subdivisiones.
General Bathymetric Chart of the Oceans (GEBCO)Conjuntos de datos globales de batimetría para los océanos.
Global Climate MonitorVisor web de datos climáticos mundiales.
Global Sea Level Observing System (GLOSS)Datos globales del nivel del mar.
HydroSHEDS databaseCapas de datos digitales globales en apoyo a la investigación hidroecológica.
IdeIBInfraestructura de datos espaciales de las Illes Balears.
LP DACCDatos espaciales diversos.
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas de cartografía MITECO (biodiversidad).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (paisaje).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (biodiversidad – especies terrestres).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (biodiversidad – Bases ecológicas preliminares para la conservación de las especies de interés comunitario en España: Invertebrados).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (biodiversidad – Áreas protegidas).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (humedales).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (bosques).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (parques nacionales).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (regiones biogeográficas).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Capas cartográficas MITECO (regiones fitoclimáticas).
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO)Miscelánea de capas cartográficas.
Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) – Infraestructura de Datos Espaciales de EspañaMiscelánea de capas cartográficas.
NASA’s Ocean Biology Processing Group (OBPG)Datos y software para análisis espacial.
National centers of Environmental Information (NOAA-NCEI)Datos espaciales diversos.
National Snow and Ice Data CenterDatos globales sobre nieve, hielo, glaciares y suelos congelados.
Natura 2000 dataCapas del programa europeo Natura 2000.
One GeologyMapa geológico del mundo.
Physical Oceanography Distributed Active Archive Center (PO DAAC)Datos oceánicos y climáticos de la NASA.
Portal de l’aigua de les Illes BalearsPlataforma en línea que proporciona acceso a datos, estudios, información y recursos relacionados con los recursos hídricos de las Islas Baleares.
SOCIBInfraestructura científica y tecnológica que proporciona flujos de datos oceanográficos gratuitos y abiertos.
Soil grids – viewerBase de datos global que almacena un sistema basado en datos que predice las propiedades y clases del suelo utilizando covariables globales y modelos ajustados a nivel mundial (visor).
World CoastlinesLinea de costa a nivel mundial (Princeton University).
World map of the Köppen-Geiger climate classificationMapa climático de Köppen-Geiger.
WorldClimDatos climáticos globales útiles para modelado ecológico.